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科學家破解植物多倍進化之謎


(綜合報導)由中國農業科學院蔬菜花卉研究所王曉武科研團隊和美國科學院院士邁克•菲林(Michael Freeling)科研團隊合作,對植物基因組多倍化進化進行了深入研究,發現了轉座子甲基化調控基因分化和多基因組分化的表觀遺傳機制,相關研究結果發表於國際權威學術雜誌《美國科學院院刊》(PNAS)上。
植物在進化過程中通過基因組加倍(多倍化)的擴增方式進行自我進化和適應自然環境。隨著DNA測序技術的快速發展,越來越多的植物基因組被公佈,通過比較基因組學來闡明植物多倍化進化機製成為可能。該研究以之前完成的白菜基因組序列為基礎,發現白菜基因組可以被劃分為3個亞基因組,而且存在一個基因數量顯著超過其它亞基因組的優勢亞基因組,並且該基因組同時在基因表達上也具有優勢。經過深入研究,同時發現轉座子(轉座子是廣泛存在於植物基因組上的一類重複序列元件)在亞基因組水平對基因表達具有重要影響,是3個亞基因組基因表達分化的重要因素;小RNA(smRNA)通過沉默轉座子從而沉默附近基因的方式,促進了優勢亞基因組的形成,從而造成了基因組層面的分化。兩種分化機制的闡明,將為解釋雜交優勢現象和C值悖論(物種結構複雜程度與基因組大小無關)提供指導。該理論成果將對基因組進化和植物遺傳育種產生重要影響。
據悉,王曉武科研團隊長期從事白菜等芸薹屬植物基因組的研究,該成果是繼2013年明確芸薹屬及其近緣物種的共同祖先基因組後,在植物進化方面又一突破性進展,也是中國農科院國際合作的又一成功實例。該研究得到了科技部973、863,國家自然科學基金等項目的資助。

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